境内には、１３棟もの重要文化財指定の建造物があり、このお寺の格式と由緒を物語っています。中でも、国内いや世界中でも唯一残っている木造十三重塔は貴重な歴史的遺産です。
　この塔は、享禄五年に再建された。屋根は檜皮葺で、初層部だけ大きく造られている。３間４方の建物で、十三層あっても高さが１６ｍ余しかない。
　初層部は、中央に板唐戸を置き、脇に連子窓を設けてある。二層目以上の軸部は低くなっている。屋根の上に置く相輪は通常法輪が九輪のところ七輪のものが置かれています。
　因みに、当麻寺の三重塔（東塔）には法輪が八輪が付いてこれも珍しいものだそうです。当麻寺にも機会があれば訪問したい。

　今までにも、十三重石塔を２度や３度は見たことがある。信貴山の朝護孫子寺・笠置山の笠置寺や兵庫区の清盛塚にもあった。その他すぐの思い出せないが、十三重石塔はあちこちで見た記憶がある。
　十三重塔巡りをするつもりはなかったので、その時々で写真を撮っていなかったから、今、十三重塔を調べてみると、写真に残していなかったことが残念です。
　国指定文化財等データベースで調べてみると、重要文化財の指定を受けている十三重塔が全国に１９塔あることが判る。下表の「重要文化財指定の十三重塔リスト」がそれです。これくらいなら、全部行ってこれるのではないかと云う気になってきます。幸いというか、殆どが近場にある。

　余談はさておいて、浮島十三重塔の話に戻します。この塔は、宇治川での殺生の罪を戒めるための供養塔として建立されました。弘安７年（１２８４年）に宇治橋の架け替えるにあたって、奈良西大寺の僧、叡尊が橋の流失が魚の祟りによるものとして、この塔を建てたと云われている。
　塔は何度か流失の憂き目にあいながらも復興を重ねてきましたが、宝暦６年（１７５６年）の大洪水で流失したあと１５０年間、川の底に埋まっていました。明治４１年に現在の姿に復興した。　

　東大寺の開山で初代別当であった良弁や、その弟子で「お水取り」の創始者とされる実忠にかかわる伝承も残っています。

　石造十三重塔は、かつて存在した木造十三重塔の跡に建てられています。鎌倉時代末から室町時代の建立です。重要文化財に指定されています。
　境内の正月堂が建っているそばにあり、正月堂の前には、笠置寺の磨崖仏の巨大な弥勒仏を本尊があります。